20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1748 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  739    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  52.57 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  31 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  32.57 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  29.29 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  26.61 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  28.75 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  25.41 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  24.93 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  22.49 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  23.64 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  25.13 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  24.25 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  24.36 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  24.51 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  23.6 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  22.99 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  26.8 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  26.18 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  21.08 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>