207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4550 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  75.51 
 
 
196 aa  311  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
195 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.24 
 
 
194 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 
196 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.85 
 
 
195 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  47.42 
 
 
195 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
197 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  43.15 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.05 
 
 
195 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000846124  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  42.13 
 
 
194 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  40.53 
 
 
193 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1100  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242851  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
193 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.92 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.4 
 
 
196 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 
199 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
198 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
206 aa  104  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  31.71 
 
 
198 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.69 
 
 
200 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.58 
 
 
191 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.78 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.78 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.78 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.78 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.78 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.16 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.16 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.17 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.76 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.12 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.2 
 
 
192 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  34.54 
 
 
201 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 
193 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 
191 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.54 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 
198 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.335878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.92 
 
 
198 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  35.29 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.41 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.12 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  33.54 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.73 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  25.5 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  0.00000000773634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 
222 aa  84.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.96 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  28.93 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.65 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.96 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.96 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.96 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.84 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.84 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.81 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  29.69 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154354  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  27.69 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0713  hypothetical protein  31.63 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  28.21 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.09 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.96 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.75 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  35.09 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.63 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.14 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  41.94 
 
 
259 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  39.09 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  39.09 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.28 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  39.09 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.93 
 
 
244 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  38.76 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  39.09 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>