35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0819 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  83.85 
 
 
192 aa  343  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  69.52 
 
 
206 aa  271  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  69.57 
 
 
248 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  67.91 
 
 
205 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  68.28 
 
 
206 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  67.38 
 
 
205 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  68.28 
 
 
206 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  68.28 
 
 
206 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  66.84 
 
 
205 aa  264  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  67.76 
 
 
201 aa  262  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  66.31 
 
 
205 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  64.17 
 
 
205 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  62.57 
 
 
205 aa  247  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  63.59 
 
 
222 aa  245  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  66.88 
 
 
180 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  64.6 
 
 
179 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  48.69 
 
 
198 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  34.38 
 
 
310 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  34.81 
 
 
346 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  32.64 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  33.75 
 
 
345 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  31.22 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  33.96 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  33.53 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  32.35 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  27.37 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  33.13 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  27.16 
 
 
197 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0612  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  43.18 
 
 
572 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.398101  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  40.91 
 
 
690 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1575  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  43.18 
 
 
587 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0255  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  43.18 
 
 
577 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.537615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0227  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  43.18 
 
 
568 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.507724  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1856  sulfate adenylyltransferase  47.37 
 
 
578 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>