198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0013 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0082  phospholipid/glycerol acyltransferase  83.98 
 
 
431 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.894855  normal  0.339877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0013  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
437 aa  868    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000782429  hitchhiker  0.0000745066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2358  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.52 
 
 
430 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00703468  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1671  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.7 
 
 
413 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.669713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0480  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.4 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10513  hypothetical protein  43.43 
 
 
358 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0672  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.81 
 
 
353 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0685  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.81 
 
 
353 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190716  normal  0.183519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0665  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.81 
 
 
353 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6739  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.96 
 
 
332 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0841  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.09 
 
 
356 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0071  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.73 
 
 
356 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0627764  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1007  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.64 
 
 
393 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02780  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.86 
 
 
308 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8336  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.65 
 
 
342 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0540  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.48 
 
 
331 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6136  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.26 
 
 
274 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0915  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.12 
 
 
363 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0664  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.22 
 
 
356 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5767  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.43 
 
 
281 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0416  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.96 
 
 
290 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378719  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4586  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.32 
 
 
302 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0346  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.48 
 
 
290 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4447  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.98 
 
 
294 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0487  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.71 
 
 
375 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0253  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.6 
 
 
309 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0622417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3215  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.86 
 
 
440 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0453  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.55 
 
 
284 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4145  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.98 
 
 
284 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.344696  hitchhiker  0.00209109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1716  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.47 
 
 
285 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.52834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0452  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.17 
 
 
284 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0228774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2222  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
433 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0576896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2132  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0424  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.93 
 
 
284 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2087  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.04 
 
 
311 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.574514  normal  0.0280378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5237  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.77 
 
 
285 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1616  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.06 
 
 
271 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5017  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.05 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1751  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.5 
 
 
356 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4527  hypothetical protein  29.02 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3855  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.87 
 
 
265 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0970  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.35 
 
 
283 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0999  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.35 
 
 
283 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5817  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.47 
 
 
281 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0331013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3759  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.05 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3832  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.05 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3771  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.05 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3689  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.12 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.73 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2873  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
281 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.266312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2917  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
281 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2903  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
281 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.863786  normal  0.473684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0359  hypothetical protein  28.29 
 
 
282 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2426  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.27 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5337  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.14 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5426  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.14 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5716  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.14 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2547  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.13 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2592  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.13 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2586  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.13 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11949  hypothetical protein  31.16 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0205  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0214  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0194  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4226  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.2 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3418  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.15 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3690  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.73 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4126  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.08 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0562  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3235  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.98 
 
 
271 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0233  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19547  normal  0.0946541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.43 
 
 
1131 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0434  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.56 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.71 
 
 
1124 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1829  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.94 
 
 
303 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428593  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2931  hypothetical protein  27.06 
 
 
280 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4047  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.53 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.56 
 
 
203 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15790  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.1 
 
 
259 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.97 
 
 
1146 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1904  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.81 
 
 
264 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0167165  hitchhiker  0.000224701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6379  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.1 
 
 
229 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 
293 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.440706  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3040  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.19 
 
 
1114 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14820  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
225 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1016  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.62 
 
 
1170 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.87 
 
 
1128 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2502  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.68 
 
 
254 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28425  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.94 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.62 
 
 
1170 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3128  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.09 
 
 
284 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520378  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1976  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.87 
 
 
214 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24820  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.91 
 
 
253 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.56063  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3044  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.37 
 
 
238 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000160916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6059  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.55 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4145  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.11 
 
 
248 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.74 
 
 
1170 aa  53.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4769  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.56 
 
 
237 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>