258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0480 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0480  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
369 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6136  phospholipid/glycerol acyltransferase  87.91 
 
 
274 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8336  phospholipid/glycerol acyltransferase  70.42 
 
 
342 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6739  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.26 
 
 
332 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0915  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.88 
 
 
363 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4586  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.55 
 
 
302 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0540  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.43 
 
 
331 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0487  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.73 
 
 
375 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0664  phospholipid/glycerol acyltransferase  56.46 
 
 
356 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0841  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.98 
 
 
356 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0672  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.07 
 
 
353 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0685  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.07 
 
 
353 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190716  normal  0.183519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02780  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  68.63 
 
 
308 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10513  hypothetical protein  56.92 
 
 
358 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0665  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.07 
 
 
353 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0071  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.98 
 
 
356 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0627764  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0416  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.45 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378719  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4447  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.8 
 
 
294 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0346  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.09 
 
 
290 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5767  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.12 
 
 
281 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1007  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.2 
 
 
393 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0253  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.68 
 
 
309 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0622417  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1671  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.63 
 
 
413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.669713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2358  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.36 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00703468  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0082  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.77 
 
 
431 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.894855  normal  0.339877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0013  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.4 
 
 
437 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000782429  hitchhiker  0.0000745066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3215  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.97 
 
 
440 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1716  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.02 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.52834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2222  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.19 
 
 
433 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0576896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2132  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.19 
 
 
447 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2087  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.41 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.574514  normal  0.0280378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0453  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.4 
 
 
284 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0452  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.94 
 
 
284 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0228774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0424  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.47 
 
 
284 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5237  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.79 
 
 
285 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4145  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.38 
 
 
284 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.344696  hitchhiker  0.00209109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1616  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.7 
 
 
271 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2426  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.51 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5017  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.56 
 
 
271 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4226  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.98 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3759  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.82 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3832  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.82 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3771  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.82 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0205  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 
264 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0214  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 
264 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0194  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 
264 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3855  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.47 
 
 
265 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0970  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.81 
 
 
283 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0999  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.81 
 
 
283 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2547  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.27 
 
 
269 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2873  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.93 
 
 
281 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.266312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2592  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.27 
 
 
269 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2917  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.93 
 
 
281 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2903  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.93 
 
 
281 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.863786  normal  0.473684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
281 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2586  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.27 
 
 
267 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4126  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.11 
 
 
268 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4527  hypothetical protein  30.62 
 
 
286 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0233  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.14 
 
 
269 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19547  normal  0.0946541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5817  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.09 
 
 
281 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0331013  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0359  hypothetical protein  32.43 
 
 
282 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0434  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.59 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3689  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.01 
 
 
283 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11457  hypothetical protein  32.95 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0199959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0562  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.3 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3690  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.5 
 
 
288 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1751  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.58 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5337  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5426  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5716  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2931  hypothetical protein  28.08 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11949  hypothetical protein  30.26 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1976  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3418  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4145  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
248 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4047  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.1 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2700  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.29 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4298  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.12 
 
 
248 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2170  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.01 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000489643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1588  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.64 
 
 
255 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.03 
 
 
237 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.11 
 
 
235 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4276  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.12 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4769  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.73 
 
 
237 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1481  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.38 
 
 
292 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1503  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.38 
 
 
292 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.75 
 
 
209 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1478  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.23 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5951  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 
244 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13850  acyltransferase  26.94 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.523346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0191  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.48 
 
 
254 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1552  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.99 
 
 
267 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.573165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5656  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.07 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1153  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.11 
 
 
194 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0454  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.82 
 
 
197 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3260  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.88 
 
 
258 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15790  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.91 
 
 
259 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3921  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
754 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2967  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.09 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1504  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.13 
 
 
210 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>