26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4546 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  98.12 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  97 
 
 		 267 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  87.83 
 
 		 258 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  61.57 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  63.02 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  64.5 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  60.07 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  59.55 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  55.81 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  82.57 
 
 		 185 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  48.48 
 
 		 198 aa  86.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  44.57 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  46.48 
 
 		 176 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  42.35 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  30.67 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  42.35 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  36.08 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  33.66 
 
 		 615 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  39.51 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  35.05 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  37.76 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>