16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1621 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  62.4 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  37.54 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  30.19 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  37.76 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  38.78 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  37.76 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  37.76 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  37.76 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  36.73 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  36.73 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  37.65 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  38.24 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>