48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4357 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  93.36 
 
 		 211 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  92.89 
 
 		 211 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  86.06 
 
 		 226 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  61.06 
 
 		 212 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  58.29 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  56.78 
 
 		 219 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  39.18 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  39.66 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  37.21 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  38.6 
 
 		 173 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  43.64 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  38.67 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  38.67 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  38 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  37.21 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  31.64 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  35.79 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  31.03 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  31.03 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  30.46 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  32.68 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  37.59 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  34.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  30.3 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  34.97 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  31.87 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  29.7 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  28.98 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  27.44 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0743  hypothetical protein  24.44 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.247142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  29.29 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  29.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  30.14 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  29.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  29.89 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  29.89 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  27.22 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  23.56 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2485  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>