19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4149 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  40.49 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  40.89 
 
 		 389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  36.04 
 
 		 403 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  34.63 
 
 		 377 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  33.49 
 
 		 393 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  29.21 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  29.86 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  29.86 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  33.53 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  27.45 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  27.45 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  26.34 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  26.84 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  26.42 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  27.17 
 
 		 390 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>