23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3957 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  100 
 
 		 155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  98.06 
 
 		 155 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  83.23 
 
 		 155 aa  260  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  79.35 
 
 		 155 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  59.35 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  55.48 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  54.19 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  46.45 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  43.05 
 
 		 156 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  43.71 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  30.83 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  30.88 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  25.53 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1173  FlgN family protein  24.36 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  25.52 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  25.52 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  25.52 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  30.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  27.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  27.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  26.03 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  29.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>