99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1973 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  320  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1878  hypothetical protein  91.56 
 
 		 154 aa  293  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4684  hypothetical protein  85.06 
 
 		 154 aa  273  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.787791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3327  hypothetical protein  83.12 
 
 		 154 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2246  hypothetical protein  82.24 
 
 		 157 aa  266  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.123131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2764  hypothetical protein  81.82 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5707  hypothetical protein  78.95 
 
 		 159 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5951  hypothetical protein  78.95 
 
 		 159 aa  253  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0717221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5947  hypothetical protein  78.29 
 
 		 180 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.392478  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4515  hypothetical protein  77.63 
 
 		 159 aa  251  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0502513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2002  protein of unknown function DUF1348  77.12 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5703  hypothetical protein  78.29 
 
 		 159 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2714  hypothetical protein  77.63 
 
 		 158 aa  248  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3482  hypothetical protein  77.63 
 
 		 157 aa  247  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0639508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1552  protein of unknown function DUF1348  76.97 
 
 		 158 aa  247  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2950  hypothetical protein  76.97 
 
 		 158 aa  246  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3095  hypothetical protein  76.32 
 
 		 158 aa  246  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0011  hypothetical protein  74.34 
 
 		 159 aa  245  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4893  hypothetical protein  74.34 
 
 		 159 aa  245  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3096  hypothetical protein  75.66 
 
 		 158 aa  244  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2722  hypothetical protein  76.32 
 
 		 158 aa  243  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1931  hypothetical protein  76.97 
 
 		 157 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2217  hypothetical protein  73.68 
 
 		 158 aa  242  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1157  hypothetical protein  73.03 
 
 		 159 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1437  hypothetical protein  73.03 
 
 		 159 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0012  hypothetical protein  73.03 
 
 		 159 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0009  hypothetical protein  73.03 
 
 		 159 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0012  hypothetical protein  73.03 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2878  hypothetical protein  74.34 
 
 		 159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.051006  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3017  hypothetical protein  73.03 
 
 		 159 aa  239  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3103  hypothetical protein  72.08 
 
 		 154 aa  239  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.45009  normal  0.493959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5658  hypothetical protein  73.68 
 
 		 155 aa  239  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0315796  normal  0.016815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3423  protein of unknown function DUF1348  72.08 
 
 		 154 aa  239  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0012  hypothetical protein  72.37 
 
 		 159 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7000  protein of unknown function DUF1348  72.37 
 
 		 159 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1126  hypothetical protein  73.68 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0675  hypothetical protein  77.18 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1516  hypothetical protein  72.37 
 
 		 202 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1555  protein of unknown function DUF1348  72.73 
 
 		 154 aa  237  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94764  hitchhiker  0.00210584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4163  hypothetical protein  72.37 
 
 		 158 aa  237  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2653  hypothetical protein  70.39 
 
 		 155 aa  236  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0650583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1059  protein of unknown function DUF1348  73.15 
 
 		 153 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3174  hypothetical protein  71.05 
 
 		 159 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7843  hypothetical protein  72.48 
 
 		 153 aa  234  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4646  protein of unknown function DUF1348  72.37 
 
 		 158 aa  233  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350473  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4514  protein of unknown function DUF1348  72.37 
 
 		 158 aa  233  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1007  hypothetical protein  68.67 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3118  hypothetical protein  70.39 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.49314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4533  hypothetical protein  70.39 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.870007 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5705  hypothetical protein  70.39 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0343113 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5154  hypothetical protein  70.39 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1039  hypothetical protein  69.93 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5318  hypothetical protein  70.39 
 
 		 159 aa  230  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4975  hypothetical protein  69.74 
 
 		 159 aa  230  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673999  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1105  protein of unknown function DUF1348  71.05 
 
 		 157 aa  230  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6181  hypothetical protein  70.39 
 
 		 156 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0912  protein of unknown function DUF1348  71.81 
 
 		 153 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71230  hypothetical protein  69.74 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2439  protein of unknown function DUF1348  69.08 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1116  protein of unknown function DUF1348  70.13 
 
 		 154 aa  225  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1522  hypothetical protein  67.76 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3483  hypothetical protein  71.71 
 
 		 157 aa  223  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3261  hypothetical protein  69.08 
 
 		 155 aa  222  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1606  protein of unknown function DUF1348  69.08 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2135  protein of unknown function DUF1348  67.76 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2837  hypothetical protein  68 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.811384  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31878  predicted protein  64.47 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0598588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2759  hypothetical protein  68 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000552736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2673  hypothetical protein  65.13 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14634  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5338  protein of unknown function DUF1348  67.11 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.563767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5610  hypothetical protein  67.74 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5318  hypothetical protein  67.74 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5230  hypothetical protein  67.74 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5027  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3296  protein of unknown function DUF1348  73.33 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  0.440493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3432  hypothetical protein  65.58 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1475  hypothetical protein  66.45 
 
 		 155 aa  210  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0042  protein of unknown function DUF1348  64.52 
 
 		 155 aa  210  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2389  hypothetical protein  67.11 
 
 		 153 aa  209  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1113  hypothetical protein  64.47 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1147  hypothetical protein  63.16 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.951304  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2823  response regulator receiver domain-containing protein  62.5 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3842  hypothetical protein  63.76 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1296  protein of unknown function DUF1348  63.58 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.555087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2347  hypothetical protein  62.03 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4265  hypothetical protein  62.25 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2665  protein of unknown function DUF1348  63.51 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1907  protein of unknown function DUF1348  66.67 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1334  protein of unknown function DUF1348  65.19 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7146  protein of unknown function DUF1348  63.91 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6224  protein of unknown function DUF1348  62.69 
 
 		 149 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.524129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2261  hypothetical protein  62.96 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  0.0392476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0802  protein of unknown function DUF1348  58.78 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28330  hypothetical protein  56.46 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0182368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1221  hypothetical protein  63.78 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0134027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4732  hypothetical protein  56.16 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.962547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0876  protein of unknown function DUF1348  60.29 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2964  hypothetical protein  58.65 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01120  conserved hypothetical protein  48.89 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>