22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1118 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 368 aa  753    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  42.63 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  25.35 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  23.78 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  24.05 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  23.97 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  24.2 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  26.35 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  23.38 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  31.62 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  23.04 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  22.56 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  22.59 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  29.03 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  31.03 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  28.89 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.57 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  22.65 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  29.17 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  31.3 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  30.77 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  27.12 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>