18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1786 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1786  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00873634  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2087  ribonuclease P protein component  76.14 
 
 		 105 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  43.08 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  35.9 
 
 		 385 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  38.81 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  44.23 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  44.64 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2333  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  46.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  36.51 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  44.64 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  33.33 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  48.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  42.11 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>