22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2087 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2087  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1786  ribonuclease P protein component  76.14 
 
 		 88 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00873634  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  35.44 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 		 385 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  32.56 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  36.49 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  26.8 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 128 aa  42  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  47.92 
 
 		 119 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  42.59 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  42.59 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2333  ribonuclease P protein component  43.64 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  46.94 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  40.3 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  46.94 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  46.94 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  45.1 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  38.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>