41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0502 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  100 
 
 
352 aa  718    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  79.55 
 
 
352 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  36.58 
 
 
442 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  34.86 
 
 
404 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  34.86 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  35.56 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  34.62 
 
 
418 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  34.62 
 
 
418 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  34.62 
 
 
418 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  34.62 
 
 
418 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  34.46 
 
 
421 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  34.27 
 
 
423 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  34.27 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  34.27 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  34.46 
 
 
411 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  34.92 
 
 
429 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  32.57 
 
 
430 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  33.78 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  33.22 
 
 
429 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  33.22 
 
 
427 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  32.87 
 
 
431 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  32.52 
 
 
429 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  32.52 
 
 
429 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  32.52 
 
 
427 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  31.41 
 
 
421 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  27.25 
 
 
380 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.25 
 
 
380 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  27.62 
 
 
370 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  29.1 
 
 
367 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  29.04 
 
 
448 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.96 
 
 
365 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  28.14 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  27.84 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  28.8 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.6 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  27.96 
 
 
365 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  29.47 
 
 
360 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  26.5 
 
 
389 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.87 
 
 
441 aa  86.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  27.21 
 
 
438 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>