77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0623 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  30.54 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  32.09 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  31.83 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  31.78 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  32.64 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  29.38 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  29.6 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  30.88 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  28.74 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  30.88 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  30.88 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  30.1 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  31.23 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  30.1 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  30.1 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  30.1 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  31.4 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  30.53 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  30.18 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  29.23 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  28.36 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  29.09 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  27.05 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  26.25 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  25.94 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.2 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  26.45 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  24.43 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  26.45 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  26.38 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25.19 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  25.25 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  26.77 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  25 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  24.56 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25.71 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  27.96 
 
 		 273 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  27.07 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000505214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000420135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  27.07 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  27.07 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  27.07 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  27.07 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000023932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  28.26 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000846548  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  29.2 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7392099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  29.2 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000911583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  25.56 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  33.11 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  29.2 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  27.61 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  26.87 
 
 		 328 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  27.54 
 
 		 287 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  26.87 
 
 		 328 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  26.87 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  27.54 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  24.81 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  27.54 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  28.47 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  27.56 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  26.77 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  23.94 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  24.67 
 
 		 340 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  27.01 
 
 		 288 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  23.01 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>