41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1335 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  100 
 
 		 404 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  95.79 
 
 		 404 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  84.03 
 
 		 408 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  56.42 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  57.67 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  48.71 
 
 		 411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  47.06 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  50.86 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  47.59 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  47.59 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  46.7 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  46.05 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  46.05 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  46.05 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  46.05 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  47.25 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  45.54 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  45.54 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  45.54 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  45.54 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  57.66 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  44.85 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  44.95 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  36.95 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  36.95 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  35.57 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  34.49 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  32.59 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  35.05 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  37.12 
 
 		 350 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  35.31 
 
 		 354 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  34.29 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  37.45 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  34.86 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  34.15 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  36.76 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  27.8 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  27.9 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  29.44 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  29.34 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  25.11 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>