More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0440 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  986    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 484 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  64.12 
 
 		 484 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  60.95 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5303  aldehyde dehydrogenase  52.15 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  51.2 
 
 		 475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  48.27 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  46.02 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  46.83 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2524  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00255525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  46.31 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  44.01 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1197  aldehyde dehydrogenase  45.08 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.238764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 		 461 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  49.51 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  45.45 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.77 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  48.77 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.77 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 459 aa  359  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 459 aa  359  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.47 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  47.79 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.99 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.79 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  43.21 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 481 aa  348  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  39.01 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  44.24 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  43.34 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1006  aldehyde dehydrogenase  47.95 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  41.46 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 480 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 480 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 480 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2489  Aldehyde Dehydrogenase  43.22 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  43 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 		 474 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  40.45 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.82 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 475 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 		 474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1965  Aldehyde Dehydrogenase  42.41 
 
 		 468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  40.64 
 
 		 490 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  40.64 
 
 		 477 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 		 474 aa  326  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 		 480 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  41.2 
 
 		 473 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 		 487 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  38.49 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 472 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 		 477 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>