18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2912 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2912  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 504 aa  1013    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000266904  decreased coverage  0.000000000278928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0219  hypothetical protein  28.6 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000733379  normal  0.0184964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2312  hypothetical protein  30.06 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267242  hitchhiker  0.00619425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5954  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.5 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000110154  normal  0.037452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4941  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.48 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01060  putative hemin receptor  27.41 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.775355  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1626  hypothetical protein  27.54 
 
 		 554 aa  127  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2269  hypothetical protein  25.32 
 
 		 535 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1548  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.57 
 
 		 538 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.769333  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.84 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  23.33 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.03 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.39 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  25.49 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.15 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.48 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.72 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.39 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>