28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4791 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  63.81 
 
 		 266 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  63.43 
 
 		 266 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  62.45 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  64.48 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  64.45 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  62.78 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  58.43 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  61.89 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  62.6 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  60 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  34.56 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  46.74 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  37.61 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  43.9 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  35.11 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  39.13 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  35.11 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  37.18 
 
 		 121 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  35.35 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.68 
 
 		 431 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  37.35 
 
 		 436 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>