More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2266 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  43.57 
 
 
3470 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  38.84 
 
 
1569 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  38.78 
 
 
2419 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.66 
 
 
4317 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  44.67 
 
 
5953 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.45 
 
 
6889 aa  845    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.34 
 
 
2385 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.41 
 
 
4336 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  39.52 
 
 
6661 aa  803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  38.71 
 
 
2155 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  43.42 
 
 
2151 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.82 
 
 
1816 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  42.39 
 
 
8914 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  41.51 
 
 
5929 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.3 
 
 
1753 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.81 
 
 
3432 aa  836    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  43.73 
 
 
4531 aa  887    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.12 
 
 
2385 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  37.23 
 
 
2385 aa  713    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  37.31 
 
 
2385 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  38.02 
 
 
7785 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  40 
 
 
3328 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  39.45 
 
 
1104 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  40.52 
 
 
3021 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  77.96 
 
 
1370 aa  2174    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.72 
 
 
4336 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  36.67 
 
 
2386 aa  698    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  43.86 
 
 
2154 aa  791    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  39.73 
 
 
4968 aa  785    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  43.09 
 
 
4136 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  41.32 
 
 
5926 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  41.19 
 
 
9498 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  40.51 
 
 
5372 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.05 
 
 
13537 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  43.83 
 
 
6676 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  45.3 
 
 
3348 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  38.29 
 
 
2867 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  40.04 
 
 
2791 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.87 
 
 
1142 aa  742    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  43.9 
 
 
3308 aa  895    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  43.57 
 
 
3498 aa  877    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.54 
 
 
2370 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  41.83 
 
 
2033 aa  774    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  42.46 
 
 
8915 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.58 
 
 
1786 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  38.28 
 
 
2883 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  33.92 
 
 
1436 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  39.81 
 
 
2187 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  39.63 
 
 
1104 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  41.67 
 
 
6072 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  41.14 
 
 
4572 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  45.48 
 
 
3291 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  40.93 
 
 
5654 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  43.4 
 
 
4502 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  36.63 
 
 
1383 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  38.9 
 
 
3291 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  42.79 
 
 
5422 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  44.28 
 
 
4882 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  41.08 
 
 
3002 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  100 
 
 
1369 aa  2779    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.03 
 
 
4332 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  36.99 
 
 
1363 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.12 
 
 
2385 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  38.69 
 
 
1126 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  43.34 
 
 
5596 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.92 
 
 
1801 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  42.29 
 
 
5328 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  39.13 
 
 
1127 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.64 
 
 
2386 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  42.25 
 
 
4489 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  41.45 
 
 
4991 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  37.88 
 
 
2156 aa  722    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  39.91 
 
 
2125 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  33.36 
 
 
1568 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.96 
 
 
1129 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  40.07 
 
 
3942 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  42.24 
 
 
3176 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  40.26 
 
 
4317 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  41.63 
 
 
4342 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  42.76 
 
 
5149 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  39.39 
 
 
2189 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  40.24 
 
 
2448 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  41.41 
 
 
3432 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  35.95 
 
 
1405 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  42.64 
 
 
2350 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 
1689 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  40.38 
 
 
1130 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  41.67 
 
 
2845 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  39.21 
 
 
1528 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  38.37 
 
 
1553 aa  683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  39.78 
 
 
1114 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  40 
 
 
3352 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  43.23 
 
 
4383 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  33.45 
 
 
1833 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  40.4 
 
 
4342 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  45.38 
 
 
8646 aa  858    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  40 
 
 
6006 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.66 
 
 
4317 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  40.32 
 
 
3331 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  42.41 
 
 
6081 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>