18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0953 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  43.69 
 
 
322 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  44.71 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  37.92 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  31.72 
 
 
296 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  30.04 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  25.82 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  23.83 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  24.6 
 
 
234 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0228  hypothetical protein  56.82 
 
 
97 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.939073  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0827  hypothetical protein  46.67 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  26.19 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  22.8 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  30.69 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  29.29 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>