23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1997 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  28.72 
 
 
314 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  29.3 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.39293e-08  hitchhiker  1.78909e-13 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  29.21 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  27.56 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  28.42 
 
 
317 aa  84.7  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  30.27 
 
 
322 aa  77.8  3e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.14648e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  27.21 
 
 
314 aa  74.3  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  27.93 
 
 
325 aa  66.6  5e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  26.03 
 
 
327 aa  63.2  5e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.47 
 
 
319 aa  58.2  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  24.05 
 
 
311 aa  51.2  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  24.05 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.1778e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  23.71 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  22.87 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.37644e-05  hitchhiker  1.22299e-07 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  24.4 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.76136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  24.4 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  23.73 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  24.05 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74716e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  23.88 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.08758e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  26.83 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  26.32 
 
 
193 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  22.41 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>