106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1967 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  309  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  71.13 
 
 
145 aa  219  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  71.63 
 
 
144 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  70.92 
 
 
145 aa  207  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  66.43 
 
 
154 aa  199  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  68.75 
 
 
143 aa  197  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  68.75 
 
 
143 aa  196  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  62.16 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  65.52 
 
 
147 aa  189  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  64.14 
 
 
144 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  64.58 
 
 
143 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  62.76 
 
 
152 aa  186  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  62.5 
 
 
146 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  64.29 
 
 
147 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  63.27 
 
 
262 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  64.58 
 
 
143 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  63.19 
 
 
143 aa  183  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  63.12 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  61.11 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  60.43 
 
 
143 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  57.14 
 
 
144 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  58.74 
 
 
147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  56.74 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  58.33 
 
 
177 aa  168  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  57.04 
 
 
146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  53.85 
 
 
154 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  52.08 
 
 
149 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  45.83 
 
 
310 aa  151  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  54.61 
 
 
144 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  50.69 
 
 
180 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  52.48 
 
 
142 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  52.48 
 
 
142 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  51.01 
 
 
162 aa  146  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  48.61 
 
 
308 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  54.01 
 
 
144 aa  140  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  54.01 
 
 
144 aa  140  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  51.8 
 
 
146 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  48.25 
 
 
148 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  50.37 
 
 
146 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  51.41 
 
 
165 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  53.73 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  48.92 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  48.91 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  42.28 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  44.44 
 
 
145 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  45.99 
 
 
156 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  48.12 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  39.86 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  40.14 
 
 
144 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  36.69 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0397  hypothetical protein  42.25 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  34.3 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  31.4 
 
 
201 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  32.19 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  32.32 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  31.29 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  32.64 
 
 
190 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  32.24 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  36.15 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  37.7 
 
 
200 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  30.67 
 
 
180 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  34.15 
 
 
223 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  35 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  25.17 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  30.71 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  32.22 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  32.65 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  37.61 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  33.85 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1986  MOSC domain-containing protein  32.14 
 
 
212 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.963912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  31.01 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  31.01 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 
200 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  32.75 
 
 
218 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
213 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
213 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  30.53 
 
 
181 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  34.04 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  25.68 
 
 
241 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  33.68 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7731  hypothetical protein  33.63 
 
 
211 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  32.28 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  26.58 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
218 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  33.96 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  33.96 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  30.43 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  28.37 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  34.88 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  30.94 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  32.56 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  28.05 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  28.23 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  33.02 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  31.48 
 
 
212 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  31.3 
 
 
232 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>