More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1879 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  69.23 
 
 
268 aa  367  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 
250 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0550  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  70.73 
 
 
250 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0373794  hitchhiker  0.0000103016 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1468  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
257 aa  272  3e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
295 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
305 aa  256  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 
249 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.65 
 
 
255 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 
275 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  48.05 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.79 
 
 
260 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
261 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.79 
 
 
260 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  48.19 
 
 
263 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 
257 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
260 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 
263 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 
278 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
264 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.82 
 
 
251 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 
257 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  50.81 
 
 
255 aa  249  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
258 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
263 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
303 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
258 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
258 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 
290 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 
251 aa  248  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
260 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.3 
 
 
254 aa  248  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
258 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 
297 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
263 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
251 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  50 
 
 
247 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.4 
 
 
256 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  50 
 
 
272 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  48.39 
 
 
259 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0836  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
260 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00992429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 
253 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  50.2 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.13 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2949  phosphate transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
267 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
252 aa  244  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2182  phosphate transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508405  normal  0.137715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0779  phosphate transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  51.2 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
269 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 
252 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 
248 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.46 
 
 
276 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  50 
 
 
293 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
269 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
269 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
269 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
269 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
258 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
257 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1905  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.18 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
255 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
255 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  49.39 
 
 
253 aa  242  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
249 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
274 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 
252 aa  241  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  50.81 
 
 
277 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.37 
 
 
273 aa  241  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  51.61 
 
 
260 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 
253 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 
275 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 
252 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
259 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 
256 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
254 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
272 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
262 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 
259 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
281 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
284 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>