More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3315 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
290 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  80 
 
 
293 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  73.46 
 
 
295 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  77.14 
 
 
247 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  72.03 
 
 
275 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.48 
 
 
281 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  72.18 
 
 
248 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  68.8 
 
 
271 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 
275 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  69.48 
 
 
271 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  68.94 
 
 
273 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  69.53 
 
 
257 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  69.53 
 
 
257 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  65.79 
 
 
271 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 
291 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.74 
 
 
284 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  65.61 
 
 
265 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 
265 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  68.67 
 
 
271 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 
265 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 
265 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  65.61 
 
 
264 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  67.73 
 
 
252 aa  364  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  65.61 
 
 
265 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.48 
 
 
263 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 
265 aa  358  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 
260 aa  354  7.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.75 
 
 
253 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  65.22 
 
 
302 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 
283 aa  349  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.96 
 
 
273 aa  346  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  64.23 
 
 
260 aa  342  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
251 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
251 aa  338  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.63 
 
 
253 aa  338  7e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.06 
 
 
253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 
253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
251 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 
251 aa  333  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  63.92 
 
 
255 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  64.43 
 
 
256 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
251 aa  332  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.52 
 
 
258 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
255 aa  332  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  60.56 
 
 
254 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 
258 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  59.69 
 
 
272 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
277 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
285 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 
301 aa  329  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
277 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 
254 aa  329  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
249 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
252 aa  328  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
253 aa  328  6e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
261 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.11 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.24 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.18 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.3 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 
272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 
284 aa  325  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
272 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 
276 aa  323  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.89 
 
 
276 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  60.32 
 
 
252 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
253 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
251 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 
272 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 
272 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 
272 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2214  phosphate ABC transporter ATPase subunit  56.83 
 
 
304 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
301 aa  322  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 
272 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 
272 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0701  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
250 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
251 aa  322  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
251 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
264 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
277 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
272 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
252 aa  321  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 
305 aa  321  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  61.04 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.2 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 
285 aa  320  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>