More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2590 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  100 
 
 		 398 aa  822    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  56.78 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  55.87 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  54.85 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  55.1 
 
 		 398 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  54.85 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  54.85 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  54.85 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  54.85 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  54.34 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  54.59 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  54.45 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  53.06 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  53.06 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  53.32 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  53.06 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  52.81 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  52.3 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  53.98 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  52.84 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  51.78 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  51.79 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  51.26 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  50.75 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  50.76 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  51.78 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  49.87 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  50.51 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  51.54 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  51.14 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  51.28 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  49.74 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  50.77 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  46.95 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  50 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  48.22 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  47.95 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  45.96 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.36 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.15 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  46.58 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  49.49 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  46.29 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  45.78 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.7 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  46.77 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.9 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.33 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  45.69 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.15 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.94 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.69 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  44.72 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  46.94 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  46.33 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  46.94 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.43 
 
 		 408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  44.53 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  44.42 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.69 
 
 		 399 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.97 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.39 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  43.91 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.54 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.55 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  45.92 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  45.11 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.78 
 
 		 415 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  43.65 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  45.48 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  44.02 
 
 		 421 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  45.52 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  45.04 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43.65 
 
 		 421 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  43.86 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.53 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  45.52 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  45.2 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  43.4 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  45.85 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  44.64 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  43.77 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  46.55 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>