16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2022 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2022  phage integrase  100 
 
 		 650 aa  1355    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1962  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 642 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.07 
 
 		 700 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  25.35 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  24.32 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  30.11 
 
 		 186 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  21.6 
 
 		 616 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 367 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 533 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>