13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1256 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1256  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00157199  normal  0.560162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0026  hypothetical protein  40.21 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0044  hypothetical protein  42.44 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.90338  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2214  hypothetical protein  40.1 
 
 
211 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1076  hypothetical protein  40.78 
 
 
212 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1258  hypothetical protein  39.8 
 
 
209 aa  121  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.226492  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1257  hypothetical protein  35.23 
 
 
227 aa  104  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0251131  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0475  hypothetical protein  34.47 
 
 
204 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915929  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1495  hypothetical protein  48.08 
 
 
105 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00154122  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1100  hypothetical protein  36.93 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000114867  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1102  hypothetical protein  36.93 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000127836  normal  0.983207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1091  hypothetical protein  35.59 
 
 
201 aa  87.8  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.108727  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1494  hypothetical protein  40.98 
 
 
68 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000124561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>