12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2214 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2214  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1258  hypothetical protein  55.29 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.226492  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0044  hypothetical protein  47.95 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.90338  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1257  hypothetical protein  45.41 
 
 
227 aa  160  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0251131  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0026  hypothetical protein  48 
 
 
195 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1076  hypothetical protein  46.33 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1256  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  125  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00157199  normal  0.560162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0475  hypothetical protein  37.14 
 
 
204 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915929  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1100  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000114867  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1102  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000127836  normal  0.983207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1091  hypothetical protein  30.59 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.108727  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1495  hypothetical protein  44.12 
 
 
105 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00154122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>