12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1257 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1257  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0251131  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0026  hypothetical protein  52.45 
 
 
195 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0044  hypothetical protein  56.37 
 
 
195 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.90338  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1258  hypothetical protein  58.58 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.226492  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2214  hypothetical protein  42.79 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1076  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1256  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00157199  normal  0.560162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1091  hypothetical protein  37.68 
 
 
201 aa  108  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.108727  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0475  hypothetical protein  34.95 
 
 
204 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915929  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1100  hypothetical protein  41.01 
 
 
203 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000114867  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1102  hypothetical protein  41.01 
 
 
203 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000127836  normal  0.983207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1495  hypothetical protein  41.58 
 
 
105 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00154122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>