12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1102 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1100  hypothetical protein  99.51 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000114867  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1102  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000127836  normal  0.983207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1091  hypothetical protein  50.72 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.108727  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2214  hypothetical protein  37.56 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0026  hypothetical protein  38.61 
 
 
195 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0044  hypothetical protein  38.69 
 
 
195 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.90338  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1076  hypothetical protein  35.98 
 
 
212 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0475  hypothetical protein  37.38 
 
 
204 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915929  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1257  hypothetical protein  40.59 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0251131  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1256  hypothetical protein  35.15 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00157199  normal  0.560162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1258  hypothetical protein  38.37 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.226492  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0518  hypothetical protein  30.51 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.27927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>