20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00038 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00038  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0940  hypothetical protein  49.8 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1864  hypothetical protein  33.2 
 
 
271 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02030  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0149  hypothetical protein  29.03 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01227  hypothetical protein  31.95 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0374911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  30.2 
 
 
323 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  27.07 
 
 
367 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0478  hypothetical protein  25.1 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4443  hypothetical protein  28.36 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0884605  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  22.45 
 
 
282 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  25.51 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  23.83 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>