14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00003 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00003  tetratricopeptide repeat domain protein  100 
 
 		 539 aa  1088    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0249  hypothetical protein  40.49 
 
 		 527 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2807  hypothetical protein  28.54 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1172  hypothetical protein  28.06 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2952  hypothetical protein  25.72 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0266  hypothetical protein  25.72 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0765  hypothetical protein  23.71 
 
 		 439 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0697  hypothetical protein  23.71 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4110  Tetratricopeptide repeat protein  19.54 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0123824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1192  hypothetical protein  24.65 
 
 		 236 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2827  hypothetical protein  24.65 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1608  hypothetical protein  23.71 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1791  hypothetical protein  23.71 
 
 		 217 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.06 
 
 		 949 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>