14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0249 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0249  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1051    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00003  tetratricopeptide repeat domain protein  40.49 
 
 
539 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1172  hypothetical protein  29.18 
 
 
422 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2952  hypothetical protein  28.71 
 
 
421 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2807  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0266  hypothetical protein  28.22 
 
 
421 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0765  hypothetical protein  22.39 
 
 
439 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0697  hypothetical protein  22.28 
 
 
439 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4110  Tetratricopeptide repeat protein  20.44 
 
 
418 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0123824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2827  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1192  hypothetical protein  27.48 
 
 
236 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6417  hypothetical protein  22.43 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1608  hypothetical protein  27.75 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1791  hypothetical protein  27.75 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>