21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0053 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  96.43 
 
 		 142 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 178 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  33.63 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  32.79 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  30.43 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.44 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  29.81 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  29.81 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>