41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0049 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0049  putative lipoprotein  100 
 
 
117 aa  243  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00580  putative lipoprotein  98.29 
 
 
117 aa  240  4e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342793  normal  0.195116 
 
 
-
 
NC_003296  RS01775  lipoprotein  74.29 
 
 
125 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00909333  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1251  hypothetical protein  65.42 
 
 
125 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5338  hypothetical protein  58.33 
 
 
145 aa  143  8e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1456  lipoprotein  58.04 
 
 
126 aa  132  2e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1389  putative lipoprotein  53.27 
 
 
118 aa  119  1e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1652  putative lipoprotein  53.64 
 
 
142 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3083  putative lipoprotein  53.64 
 
 
142 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3466  putative lipoprotein  53.64 
 
 
142 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0108  hypothetical protein  53.64 
 
 
142 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3969  putative lipoprotein  53.64 
 
 
142 aa  116  8e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3888  putative lipoprotein  53.64 
 
 
140 aa  115  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3205  hypothetical protein  57.14 
 
 
164 aa  113  7e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2913  hypothetical protein  55.91 
 
 
142 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3561  putative lipoprotein  54.08 
 
 
118 aa  109  1e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0961019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4601  putative lipoprotein  47.27 
 
 
119 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4280  putative lipoprotein  48.18 
 
 
119 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1450  putative lipoprotein  47.12 
 
 
118 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2722  putative lipoprotein  47.12 
 
 
118 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2998  hypothetical protein  56.32 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.858311  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2390  hypothetical protein  57.65 
 
 
162 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3004  hypothetical protein  57.65 
 
 
162 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1338  putative lipoprotein  47.12 
 
 
133 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3023  hypothetical protein  57.65 
 
 
143 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4222  putative lipoprotein  46.46 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.831557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4013  putative lipoprotein  46.46 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.567759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3428  hypothetical protein  40.65 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2760  hypothetical protein  40.65 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5408  hypothetical protein  42.73 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0881  lipoprotein  40.38 
 
 
135 aa  63.5  9e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1765  putative lipoprotein  30.19 
 
 
116 aa  57.8  5e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0225927  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4672  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  57  7e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22674  normal  0.0530626 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1494  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  56.2  1e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4119  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
118 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1130  integrase/recombinase  34.91 
 
 
134 aa  52.8  2e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05524  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  52.8  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0421  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  47.4  7e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0422  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  47.4  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3788  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0370713  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0393  hypothetical protein  29 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>