More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2680 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2342  Aldehyde Dehydrogenase  65.38 
 
 
506 aa  700  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2131  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  78.66 
 
 
506 aa  848  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.183507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0584  aldehyde dehydrogenase  86.36 
 
 
506 aa  905  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0703  aldehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
506 aa  705  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481981  normal  0.0197886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0194  aldehyde dehydrogenase family protein  69.37 
 
 
505 aa  706  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6715  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 
514 aa  698  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1743  aldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
510 aa  716  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.356193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1414  aldehyde dehydrogenase  70.36 
 
 
506 aa  772  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0344  aldehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
541 aa  717  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2967  aldehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
501 aa  635  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.339954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3083  aldehyde dehydrogenase  99.8 
 
 
506 aa  1040  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1742  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  70.36 
 
 
506 aa  757  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1192  aldehyde dehydrogenase  65.94 
 
 
508 aa  730  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0271  aldehyde dehydrogenase  68.56 
 
 
505 aa  697  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0248  aldehyde dehydrogenase  72.92 
 
 
506 aa  801  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3272  aldehyde dehydrogenase  65.94 
 
 
507 aa  686  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329246  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3732  Aldehyde Dehydrogenase  66.87 
 
 
507 aa  714  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3310  aldehyde dehydrogenase  87.55 
 
 
506 aa  918  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1085  acetaldehyde dehydrogenase 2  86.96 
 
 
506 aa  911  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3281  aldehyde dehydrogenase  76.48 
 
 
505 aa  811  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2260  aldehyde dehydrogenase  68.29 
 
 
502 aa  723  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10465  aldehyde dehydrogenase  62.57 
 
 
507 aa  664  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2788  Aldehyde Dehydrogenase  67.13 
 
 
507 aa  701  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0108664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1964  aldehyde dehydrogenase  86.76 
 
 
506 aa  910  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00163057  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1585  Aldehyde Dehydrogenase  68.09 
 
 
506 aa  729  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3181  aldehyde dehydrogenase  67.34 
 
 
504 aa  723  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1694  Aldehyde Dehydrogenase  66.86 
 
 
507 aa  720  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.795203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1552  aldehyde dehydrogenase family protein  69.11 
 
 
539 aa  696  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0599  aldehyde dehydrogenase  70.55 
 
 
506 aa  739  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213204  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3514  aldehyde dehydrogenase  66.4 
 
 
506 aa  724  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192825  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3320  aldehyde dehydrogenase family protein  69.11 
 
 
539 aa  696  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1890  aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
507 aa  720  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.943834  normal  0.754325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3013  aldehyde dehydrogenase  72.33 
 
 
506 aa  722  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3230  aldehyde dehydrogenase  68.18 
 
 
506 aa  731  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0248  aldehyde dehydrogenase  72.92 
 
 
506 aa  801  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3936  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  69.11 
 
 
570 aa  696  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4008  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  69.11 
 
 
539 aa  696  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0364  aldehyde dehydrogenase  72.53 
 
 
506 aa  800  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.601797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0143  lactaldehyde dehydrogenase  66.73 
 
 
512 aa  719  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0125  aldehyde dehydrogenase  65.74 
 
 
512 aa  704  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0957  aldehyde dehydrogenase  65.32 
 
 
501 aa  643  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.289465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7559  Aldehyde Dehydrogenase  68.5 
 
 
506 aa  732  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4952  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 
507 aa  684  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117167  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3574  aldehyde dehydrogenase  73.12 
 
 
506 aa  805  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3050  aldehyde dehydrogenase family protein  69.11 
 
 
539 aa  696  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0620  aldehyde dehydrogenase  66.14 
 
 
507 aa  700  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726946  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3410  aldehyde dehydrogenase  74.9 
 
 
506 aa  814  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0134  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
508 aa  733  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3915  aldehyde dehydrogenase B  65.74 
 
 
512 aa  704  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2498  Aldehyde Dehydrogenase  83.79 
 
 
506 aa  875  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1974  aldehyde dehydrogenase  79.05 
 
 
506 aa  831  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3616  Aldehyde Dehydrogenase  66.87 
 
 
507 aa  715  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1399  Aldehyde Dehydrogenase  67.27 
 
 
506 aa  703  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3958  aldehyde dehydrogenase B  66.53 
 
 
512 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.159408  normal  0.706216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3123  aldehyde dehydrogenase  96.44 
 
 
506 aa  994  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0519809  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4003  aldehyde dehydrogenase B  66.53 
 
 
512 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0590  aldehyde dehydrogenase  86.36 
 
 
506 aa  904  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363947  normal  0.154407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0024  Aldehyde Dehydrogenase  67.48 
 
 
506 aa  721  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0597  aldehyde dehydrogenase  86.17 
 
 
506 aa  903  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.04991  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4003  aldehyde dehydrogenase B  65.74 
 
 
512 aa  704  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2104  aldehyde dehydrogenase  71.74 
 
 
506 aa  746  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2852  aldehyde dehydrogenase  64.39 
 
 
506 aa  694  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0010  aldehyde dehydrogenase  68.29 
 
 
506 aa  723  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0379018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6813  aldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 
506 aa  704  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160614  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3615  aldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 
506 aa  704  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2779  aldehyde dehydrogenase  68.9 
 
 
506 aa  703  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0148  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
508 aa  729  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135185  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2254  aldehyde dehydrogenase  73.72 
 
 
506 aa  816  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0149  aldehyde dehydrogenase  68.5 
 
 
507 aa  731  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.1483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3879  aldehyde dehydrogenase B  66.73 
 
 
512 aa  712  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.565501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3894  aldehyde dehydrogenase B  66.53 
 
 
512 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4065  aldehyde dehydrogenase B  66.53 
 
 
512 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3506  Aldehyde Dehydrogenase  67.89 
 
 
502 aa  724  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2410  aldehyde dehydrogenase  77.08 
 
 
506 aa  821  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893854  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0269  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  73.52 
 
 
506 aa  812  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4086  aldehyde dehydrogenase B  65.74 
 
 
512 aa  704  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3793  aldehyde dehydrogenase B  65.74 
 
 
512 aa  704  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02420  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  70.36 
 
 
506 aa  774  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0366  aldehyde dehydrogenase  69.92 
 
 
506 aa  733  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141497  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1862  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  79.05 
 
 
506 aa  830  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2872  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  71.34 
 
 
506 aa  762  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3942  aldehyde dehydrogenase  71.74 
 
 
506 aa  793  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1095  aldehyde dehydrogenase  68.08 
 
 
506 aa  722  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2370  Aldehyde Dehydrogenase  65.85 
 
 
500 aa  704  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3423  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
507 aa  714  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0352428  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1790  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  78.66 
 
 
506 aa  848  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.308422  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4958  aldehyde dehydrogenase B  65.74 
 
 
512 aa  704  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0132  aldehyde dehydrogenase  68.5 
 
 
508 aa  719  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239078  normal  0.798245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5650  aldehyde dehydrogenase  71.68 
 
 
507 aa  769  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260352  hitchhiker  0.00474068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0251  aldehyde dehydrogenase  72.92 
 
 
506 aa  801  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1366  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  69.64 
 
 
511 aa  733  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1159  aldehyde dehydrogenase  69.17 
 
 
506 aa  729  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0895  aldehyde dehydrogenase  64.72 
 
 
501 aa  642  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0252  Aldehyde Dehydrogenase  72.73 
 
 
506 aa  800  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  5.71584e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4158  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  66.6 
 
 
511 aa  706  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4989  aldehyde dehydrogenase  86.17 
 
 
520 aa  904  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2916  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
519 aa  671  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.155375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24920  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  64.09 
 
 
506 aa  698  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0138  acetaldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 
506 aa  696  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1089  aldehyde dehydrogenase  67.06 
 
 
507 aa  711  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>