31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1424 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  98.99 
 
 
99 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  64.29 
 
 
110 aa  135  3e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  57.73 
 
 
119 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  49.47 
 
 
102 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  63.38 
 
 
109 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  54.35 
 
 
101 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  53.19 
 
 
104 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  53.26 
 
 
101 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  56.25 
 
 
97 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  53.57 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  61.04 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  59.46 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  56.96 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  49.43 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  51.39 
 
 
82 aa  82  3e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  43.24 
 
 
85 aa  75.1  3e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  54.17 
 
 
57 aa  61.6  3e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  35.38 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  35.38 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  35.38 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  36.67 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  38.78 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.50484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  33.85 
 
 
92 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  27.94 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  27.94 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  26.25 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  34.69 
 
 
92 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>