17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13396 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  100 
 
 		 680 aa  1414    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88822  predicted protein  39.07 
 
 		 774 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  decreased coverage  0.00889443 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03720  Protein transport protein sec24 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6W0]  40.12 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00260  ER to Golgi transport-related protein, putative  37.8 
 
 		 920 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00276078  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88354  SED5-binding protein 2 (SEC24-related protein 2) component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  35.27 
 
 		 907 aa  405  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  30.93 
 
 		 1031 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  30.87 
 
 		 777 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81443  sec-24-like membrane protein involved in ER to Golgi vesicular transport  27.96 
 
 		 939 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.181556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01000  ER to Golgi transport-related protein, putative  26.27 
 
 		 1003 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779666  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48220  predicted protein  26.93 
 
 		 1041 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313872  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80516  component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  21.39 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.461247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24928  predicted protein  24.15 
 
 		 824 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.490634 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  21.1 
 
 		 816 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47270  predicted protein  25.97 
 
 		 897 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42673  predicted protein  21.32 
 
 		 759 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01150  hypothetical protein  21.74 
 
 		 763 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.966337  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53063  predicted protein  22.99 
 
 		 897 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>