128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45111 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  100 
 
 
126 aa  242  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  50.91 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  47.22 
 
 
112 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  45.37 
 
 
108 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  49.54 
 
 
119 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  47.22 
 
 
111 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  50.46 
 
 
118 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  49.09 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  49.09 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  47.27 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  51.49 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  44.25 
 
 
115 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  44.04 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  44.44 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  44.04 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  44.04 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  41.67 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  51.61 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  45.28 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  46.73 
 
 
111 aa  87.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  51.11 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  42.73 
 
 
111 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  43.52 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  44.04 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  43.64 
 
 
111 aa  84.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  42.73 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  48.94 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  41.07 
 
 
113 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  41.94 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  41.82 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  43.69 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  43.52 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  46.43 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  46.43 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  39.09 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  40.91 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  43.62 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  41.12 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  37.38 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  39.25 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  41.84 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  37.86 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  38.53 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  38.32 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  38.32 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  37.61 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  39.25 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  38.89 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  37.74 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  37.74 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  40.19 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  32.23 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  40.74 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  36.11 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  35.85 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  32.11 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  36.89 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  35.85 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  38.32 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  35.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  39.25 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  36.45 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  31.78 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  31.19 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  29.09 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  48 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  31.78 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  33.03 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  35.92 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  33.03 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  33.65 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  30.84 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  29.73 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  35.64 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  34.95 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  35.85 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  32.14 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4121  protein of unknown function UPF0060  37.38 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.994697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  31.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  31.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  31.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>