17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39243 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  100 
 
 
168 aa  326  7e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  70.59 
 
 
446 aa  212  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  58.82 
 
 
214 aa  175  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  58.82 
 
 
256 aa  174  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  68.24 
 
 
622 aa  173  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  56.47 
 
 
1567 aa  166  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  48.86 
 
 
262 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  47.19 
 
 
386 aa  136  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  47.34 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  42.26 
 
 
1030 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  36.53 
 
 
931 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  36.88 
 
 
1140 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  33.12 
 
 
614 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.97 
 
 
2082 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  27.78 
 
 
3320 aa  51.6  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  29.17 
 
 
516 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44846  predicted protein  36.08 
 
 
450 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>