15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17166 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  100 
 
 
500 aa  1044    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  30.46 
 
 
379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  30.47 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  27.84 
 
 
422 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  25.73 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  24.52 
 
 
407 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  22.71 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  24.64 
 
 
431 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07679  COPII-coated vesicle protein (Erv41), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01530)  24.11 
 
 
394 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  27.49 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53869  predicted protein  24.69 
 
 
352 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157249  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  30.19 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  23.61 
 
 
520 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  35.71 
 
 
513 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  29.29 
 
 
534 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>