14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12896 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  100 
 
 		 525 aa  1092    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119509  hypothetical protein  36.41 
 
 		 519 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07554  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14810)  34.84 
 
 		 663 aa  273  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  hitchhiker  0.00734337 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86611  Predicted component of NuA3 histone acetyltransferase complex  29.81 
 
 		 610 aa  250  5e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04020  nucleus protein, putative  32.19 
 
 		 678 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  28.28 
 
 		 239 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  24.79 
 
 		 273 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  25.23 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  23.21 
 
 		 273 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  25.62 
 
 		 299 aa  47.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  24.22 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.52 
 
 		 238 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.52 
 
 		 238 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.52 
 
 		 237 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>