14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3424 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  98.69 
 
 
306 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  52.42 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3934  hypothetical protein  46.4 
 
 
279 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00016273  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  38.71 
 
 
245 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 
530 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  37.04 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  32.97 
 
 
529 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  29.35 
 
 
514 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  33.7 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  31.25 
 
 
476 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.32 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27.45 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.36 
 
 
528 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>