36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3174 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
290 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  74.05 
 
 
289 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  74.05 
 
 
289 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  71.38 
 
 
290 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  71.08 
 
 
298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  69.55 
 
 
289 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  66.32 
 
 
299 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  43.91 
 
 
293 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  37.71 
 
 
304 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  25.82 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  24.29 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  27.17 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  25.26 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  30.89 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  43.84 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 
226 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  30.18 
 
 
226 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  43.84 
 
 
78 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  45.21 
 
 
80 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  39.73 
 
 
77 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  29.13 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  30.71 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 
219 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2323  putative ferredoxin  32.88 
 
 
76 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0740  hypothetical protein  26.36 
 
 
207 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.439983  hitchhiker  0.00000000106708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0588  hypothetical protein  26.36 
 
 
207 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  36.51 
 
 
86 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  24 
 
 
290 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
862 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>