25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0225 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  32.97 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1915  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.67 
 
 
1068 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  25.13 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2633  hypothetical protein  20.75 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  45.9 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  25.25 
 
 
260 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
743 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  45.9 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  40.68 
 
 
178 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  44.83 
 
 
169 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  35.21 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  23.88 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
819 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1402  hypothetical protein  22.1 
 
 
247 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.526753  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1569  hypothetical protein  30.61 
 
 
176 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  decreased coverage  0.00826206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  34.29 
 
 
275 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  46.2  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
723 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  30.23 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
770 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
737 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
755 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0059  hypothetical protein  30.26 
 
 
152 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>