26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1402 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1402  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.526753  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0191  hypothetical protein  58.78 
 
 
253 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0804996  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6529  hypothetical protein  56.72 
 
 
240 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  0.0666444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1719  hypothetical protein  53.42 
 
 
239 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2096  hypothetical protein  51.26 
 
 
246 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.756279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3620  hypothetical protein  47.26 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0981  EcsC protein  46.03 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1050  hypothetical protein  46.03 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1127  EcsC protein  45.83 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1215  EcsC protein  45.42 
 
 
235 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2555  hypothetical protein  51.08 
 
 
251 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347074  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1154  EcsC protein  45.42 
 
 
235 aa  207  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0960  EcsC-like protein  45.42 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0970  protein EcsC  45.61 
 
 
235 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0817  protein EcsC  44.58 
 
 
235 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0965  EcsC protein  44.77 
 
 
235 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1086  EcsC protein  44.77 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4218  EcsC protein  44.77 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.518575  normal  0.0909474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  28.92 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  23.32 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2633  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  23.19 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  22.1 
 
 
370 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1915  cation transporter E1-E2 family ATPase  23.49 
 
 
1068 aa  52  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  22.91 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4621  hypothetical protein  25.28 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  decreased coverage  0.0000000039388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>