21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  96.45 
 
 		 141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  56.55 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  56.25 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  40.2 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  29.09 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  29.09 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  31.48 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  27.69 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.2 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  36.27 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  23.93 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  23.93 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  23.93 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  32 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  27.69 
 
 		 144 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  29.89 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  30.34 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>