17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3498  hypothetical protein  31.06 
 
 
249 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131398  normal  0.0583742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1256  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  58.9  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2935  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1240  hypothetical protein  27.66 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2247  hypothetical protein  29.18 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.425538 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1019  hypothetical protein  26.83 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1287  hypothetical protein  26.02 
 
 
213 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0872  hypothetical protein  24.02 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1174  putative bacteriophage protein  25.24 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.552425  normal  0.0203947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  41.56 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0815  putative bacteriophage protein  25.89 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.760606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  40.85 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  43.84 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  36.36 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  40 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  38.55 
 
 
193 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>